没有了外敌觊觎，但是也因为在外敌到来时九仙派毫无抵抗之力，是以虽然依靠帝皇派以及逍遥派赶走了外敌，但是九仙派的名气却是没有得到提升，反而愈加让人看不起了。
这种情况一直持续到万年前，情况才有了改变。
在这个时候，从九仙派门第二百十一代传人中，竟出了一个惊才绝艳、领袖群伦的绝世人物……南华真人。
南华真人原是一凡间王朝小吏，天资聪颖过人，却怀才不遇，一直得不到重用，后机缘巧合拜入九仙派第二百一十代掌门华阳真人门下，年仅二十岁。
南华入门后仅用三年时间便将华阳真人所传的道法领悟贯通，又过一年，便连华阳真人也只不是他的对手。
华阳真人惊喜交加，断然将祖师老子传下的九转仙诀拿出，传于南华自行参祥。南华便就此在凌云峰后山“无极洞”闭关。
这一关便是五十多年，南华将老子传下的九转仙诀修炼到了六转极致，后来发现九转仙诀后面三转老子也只是有大概的描述，却是没有了修炼之法，却是当年老子天纵奇才也只是修炼到六转，往后再无突破，纵是如此老子也是称雄天下，几乎天下无敌。
南华天资聪颖，心志坚定，凭借在无极洞内机缘得到老子留下的残缺太清仙诀，南华硬是突破了自身极限，破关而出。
其后，南华正式出家，自称南华真人，又名庄子。
华阳真人随即将掌门之位传给了南华真人，南华接任后励精图治，努力发展九仙派，严苛挑选弟子，加上九转仙诀威力极大，数百年间，九仙派已经恢复了往日的荣光，成为了正道支柱，随后正魔大战，南华真人带领九仙派联合帝皇派，逍遥派以及极乐寺大败邪教魔教，巫教和妖教，九仙派声望也是达到顶点，领袖正道各门诸派。
南华真人高寿两千三百多年而逝，他的九个弟子随后在九仙山九峰传下道统。其中长门居于主峰凌云峰九仙观中，是一门重心所在。
时至今日，九仙派门下弟子已近万人，高手如云，与帝皇派、逍遥派以及极乐寺并列为当世四大门派。而掌门玄清真人，修为更是超凡入圣，领袖绝伦。
九仙派崇尚无为，是以得道者多事喜好清净之
